From: Chris Date: Thu, 5 Feb 2015 23:13:54 +0000 (+0100) Subject: Begonnen met sws opdracht. X-Git-Url: https://git.martlubbers.net/?a=commitdiff_plain;h=7ebf8df21ecdea17193660b93e9915cc896934c0;p=sws1-1415.git Begonnen met sws opdracht. Alle bash onderdelen gedaan, nu nog een c bestand schrijven en een makefile maken. --- diff --git a/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise1/1b.txt b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise1/1b.txt new file mode 100644 index 0000000..beb7404 --- /dev/null +++ b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise1/1b.txt @@ -0,0 +1 @@ +12334 diff --git a/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise1/commands.txt b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise1/commands.txt new file mode 100644 index 0000000..2ae78c6 --- /dev/null +++ b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise1/commands.txt @@ -0,0 +1,2 @@ +mkdir -p sws1-s4109503-s4202015/exercise{1,2} +echo -e "s4109503 Mart Lubbers\ns4202015 Chris Kamphuis" >./sws1-s4109503-s4202015/names.txt diff --git a/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/2a.txt b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/2a.txt new file mode 100644 index 0000000..8e0500d --- /dev/null +++ b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/2a.txt @@ -0,0 +1 @@ +cat genome.txt | tr -d '\n' | grep -o 'GATTACA' | wc -l diff --git a/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/gengenome.sh b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/gengenome.sh new file mode 100644 index 0000000..15dcc58 --- /dev/null +++ b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/gengenome.sh @@ -0,0 +1 @@ +cat /dev/urandom | tr -cd 'ACGT' | fold -w 100 | head -500 diff --git a/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/genome.sh b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/genome.sh new file mode 100644 index 0000000..f6c2ecd --- /dev/null +++ b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/genome.sh @@ -0,0 +1 @@ +cat $1 | tr -d '\n' | grep -o $2 | wc -l diff --git a/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/genome.txt b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/genome.txt new file mode 100644 index 0000000..47a620c --- /dev/null +++ b/ass1/chris/sws1-s4109503-s4202015/exercise2/genome.txt @@ -0,0 +1,500 @@ +AATAAGAAATCATCCCTGTGCACTTAGGCGGGTTCTGAGATAGAAATGCGCATGAATAGCGTAAGTAGGATCCACAAGATCTAGAATAATTCGATCGAGC +GATAAAGGATCGGGGTCCCGGAATAACTTCTGCAGTTCATGCTAACCGTGCCATGAGCACCTTATGAGCGAAGTCACAGTTACCCCAGCACGACTAATCA +TAACGTTTCATGTGAGTGGGAACGGGATTAAATTGCCGGCATTACAATAGGCTCTGCGGCGGTAGCTAGACCTGCTTTCATACCAGGCATCATACCGCAT +GCGGTGTAATGTCGATCATAGCAGTAGTTGCGAACGACTTAAGCCTTAGGACCACGAAATCGCGATCAATCCGATTTAGGATCGAACCCACAACATGACA +CAAGAGCGGGGCACCCTTTGGACACTTAAGATTACGCTAAGTGCCGATGGTCACCAACTTGCACGACGCAAACAGCAACCTACCCATTGGGGTTTCCATT +GCGAGTACGGCCTGAGTTACGCTCATTCTTATTATTATTGACTTGAGTATTACCATGTGCGCTCGCCGTTAATTGATGTAGAACGGACCGACCTTCTTGT +AAGCCACGGCATCTACGTAACAAAGTGCGATACTGCCTATATAAAGTAGACAACGACAAACTTGCGTAATCCGAAACTGCCTGTCACGTCGCTATGGTGA +GAACATTCTGTCTGAACAAAATAACGGAAATGAACTCTGAGTCAAAAAACCAAGATACCTCCAAATGGTACCAATAGCTTCCGTCTCTTAGCGGAGCTCC +GTACTTCGCGCTAGAATGCAAGGATGTCCGCACGGGGTAAAAGAAAGGGTACGCATAACCGTAGGCGGCCTTGACGCTGCACTATGTCGTCTGGAGACGA 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+GGTACTGAGCTTCCCCAGGTATGGAACGCTGTAGCAGCGCGGAGTCATGCGACCCTAGAGGCCACTGGCGAGTGCTGCCCGAAGCTAGAGCACAGGGTAA +TTACGTATGACTATCGCCCACTTCTCTCTTGCGGAGCCGCTTAGAGTCCATAGCGAGTATCACGCTTTTAGGGACCTACCCTGAAAATGGTCTCAGTTGG +CGTATACAGCGGTCCCGAGTGCCCAGAAGGACGAGGCACGCCCGACACCTAACACAGGGCGGGATACGAAGGATTAAGTAGCGATGACACTTGAACGAGG +CACTTCACTTGTGAGGCAATATTGGCGAATCATCGCGGGCCAATACCGATAAAATTAGTTTCAGCGTCTCGACTGTCCCGAAAATAGCAACCGCGATTCT +GGATTGAATAGAGACAAGCCAGTCCCCCATAGATATTACTCCTAGGGGTCTGCGCCACGAGCGCTTTGAGAAGGGCTCCTTGGGTTACATGTTGATCCAG +AGGATAACGCACAGGAGTGCGTGGATACGGTTATGGGTAGACGTTCTGGATTACATCCTCTGGTATCCACTCGGGCCCGTTTGTCCATGGCGGCTGTAAG +ACATGCTTGGTGGAGAGGGGCATCCTACACTCAGACGCTAGAGTGTTTTTTAACCGTTCCAATGCTAGGTGCCATACAGCTTTCCGAAGGGACGCGGCTA +GAAGCTGTTCGGGTTCCTATTAATAAGCTAACACCCACACAGCTAAGTAAACAACGAGATGCACGCACTATTTTCGCAACGACTAGGCACCAGATCCCTA +AATTATATAATCCTGACGCGAGTGAAGCACGTATAGGAGTAAGTACGCTCTTGGCCGACGCAGGTAAGGGTGAAGTCATTGGTAAGTATGCATTTGATTC 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+CCAATTATAGACCCCACTCCTCTTATCTGACTTCGGCAATTGCATACTATCAAAGGGAGATAGGCCCTCTTGTGTGGGCGCGTAGTTGCGAGCGCTATTG +CCGTACAGCGTTAATAAGCTAGGGGAGAGTTATCATTATTCGTCCGGCGTCTTCATTTAGAACAGGTGAAGTTATTCGAGAGGCCGTGCCTTCTTGTCAA +GTCCAGACCTAGTTGGGACTGTCGAAACACCTCTTCCGTGAGTAGGGAATATACCTACATCGGAATGCTCGCTCCTGTGAGACCTTCCACGGATCGCCCC +GCAGGAGACCCTGGCTAAACCGCAGAAGAAGCTCCCAATAGTTCGCGCTAAAGGTCATTGTTCAAATAGCAATAATCTATGACTGGTAAAATAAAGGATA +CGCCAGCCTACCCATAGGACGTGCAGGAGGCCCTTCCATGTTCTTAGCATTTCACCATCAACTATACCAGTCGCGTTAACATATAGCTCAAGTCAATCTG +ATAAACGGTGTGTCATAACGAAACTAAATTGAAGCCGATGGGTTTAAGCCGTAGCGCAGGTAAGTCATTGCAGTGCCCGTTTGCTAACATGAGATACCCG +TCGAGTAATCCAATGAAATCACTATTTGCGGCATGCTTGCGGATTGCATGCCCTAATCCAAGGAGCTTAGTGAACTTAACTCGAAACACATCGGAGTAAA +AGTTCCGTAAATTATGGAGAAGCAGACGAAATGGAATCGTATTTTATTATTCGTCCAAGATGTGGGAAGCCAGACGCTCCCGACAGTTTCCCGCCGGGGG +CCAGTGAATGGTGGCCAGTTCTGAACAGGCCACCCTTGAATGGCAACGACGGCGGCGGATGTTGTCCGGCTATCCGAGAGATCCGCCGACCACAAACCGC 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